Theo kết luận của cơ quan An ninh điều tra, Bộ Công an, trong quá trình hoạt động, trường Đại học Đông Đô chưa được Bộ Giáo dục & Đào tạo (GĐ&ĐT) cho phép đào tạo văn bằng 2. Nhưng suốt từ năm 2015 trường này đã đăng ký chỉ tiêu tuyển sinh và được Vụ Kế hoạch tài chính, Bộ GĐ&ĐT thông báo chỉ tiêu tuyển sinh và được Vụ Giáo dục đại học cho đăng tải “Đề án tuyển sinh” lên cổng thông tin tuyển sinh của Bộ GĐ&ĐT trong đó có chỉ tiêu hệ văn bằng 2 khối ngành III, V, VII chính quy.