Cụ thể, Điều 5 dự thảo Luật nêu rõ, tổ chức Tòa án chuyên biệt tại TP. HCM. Căn cứ tình hình thực tế và yêu cầu giải quyết vụ việc tại Trung tâm Tài chính quốc tế, Chánh án TANDTC quyết định thành lập và tổ chức Tòa án chuyên biệt khác.
Cơ cấu tổ chức của Tòa án chuyên biệt bao gồm:
- Tòa Sơ thẩm Tòa án chuyên biệt;
- Tòa Phúc thẩm Tòa án chuyên biệt;
- Bộ máy giúp việc.
Bên cạnh đó, Tòa án chuyên biệt có Chánh án, Phó Chánh án, Chánh tòa, Phó Chánh tòa, Thẩm phán, Thư ký Tòa án, công chức khác và người lao động. 4. Chánh án TANDTC quyết định thành lập, quy định nhiệm vụ, quyền hạn của Bộ máy giúp việc của Tòa án chuyên biệt.

Nhiệm vụ, quyền hạn của Tòa án chuyên biệt được quy định tại Điều 6 như sau:
- Xét xử, giải quyết tranh chấp trong hoạt động đầu tư, kinh doanh tại Trung tâm Tài chính quốc tế;
- Giải quyết yêu cầu trong hoạt động đầu tư, kinh doanh tại Trung tâm Tài chính quốc tế;
- Tổng kết thực tiễn xét xử, bảo đảm áp dụng thống nhất pháp luật trong xét xử;
- Áp dụng pháp luật nước ngoài, án lệ nước ngoài, tập quán thương mại quốc tế; án lệ, tập quán thương mại trong xét xử.
- Thực hiện nhiệm vụ, quyền hạn về thi hành án;
- Thực hiện nhiệm vụ, quyền hạn khác theo quy định của pháp luật.
Dự thảo Luật Tòa án chuyên biệt tại Trung tâm tài chính quốc tế cũng quy định nguyên tắc tổ chức và hoạt động của Tòa án chuyên biệt như sau:
- Độc lập theo thẩm quyền xét xử.
- Bảo đảm quyền bình đẳng trước pháp luật và Tòa án.
- Thực hiện quyền tư pháp kịp thời, công bằng, công khai, vô tư, khách quan.
- Chế độ xét xử sơ thẩm, phúc thẩm được bảo đảm.
- Thẩm phán xét xử độc lập và chỉ tuân theo pháp luật.
- Thực hiện tranh tụng trong xét xử.